有机酸可通过解离出的酸根离子或者氢离子进入细菌细胞膜内使胞内渗透压增加，内环境的酸值降低，导致细菌正常代谢紊乱，甚至裂解死亡，间接降低有害细菌的数量。
有机酸不仅可以降低环境中的 pH 值，还可以通过破坏细菌细胞膜、干扰细菌酶的合成、影响细菌 DNA 的复制等达到抑菌的目的。
在有机酸中杀菌抑菌效果最强的就是甲酸类。甲酸钙、二甲酸钾等作为经过处理的有机酸制剂，相比于液体有机酸的刺激性，它们在使用时性能更稳定。
有机酸可促进水产动物对食物的吸收、提升蛋白质的利用率，进而提高水产品的产值与品质，在鱼类虾类河璧等中大量使用。
甲酸钙作为有机酸化剂通过提高饲料的酸度，使胃蛋白酶、胰蛋白酶等的活性增强，代谢活动变强,增加水产动物对饲料的消化效率促进生长。
甲酸钙在具备杀菌护肠促消化的作用外，还能提供30.1%的小分子有机钙源，补充水产动物生长所需的钙质。
03加强消化和抗应激作用有机酸通过影响代谢活动,提高酶活性来促进水产动物的消化。有机酸能够减少氨的合成和控制生成有害的代谢产物，还能阻碍免疫介导因子的合成和分泌，提升机体抵抗力。有机酸通过促进水产动物肠道内有益菌 (如双歧杆菌)的繁殖,控制有害菌繁殖,使肠道菌群结构向好的方面改变,促进维生素钙等的吸收,提高水产动物的抗病能力和抵抗力。
有机酸能够参与三羧酸循环和ATP的生成与转化, 加快水产动物的代谢；还参与氨基酸的转换, 在应激原的刺激下, 机体可合成ATP, 产生抗应激作用。
04缓解金属毒性，降低养殖环境的污染有机酸以水体泼洒的方式进入养殖环境中，通过吸附、氧化或者络合Pb 、Cd 、Cu 、Zn等重金属，减缓重金属的毒性。乙酸有利于重金属 Cd2+ 向交换态转变，在一定范围内质量摩尔浓度增加，解毒效果越好。此外，有机酸还可使养殖废水中的分子氨转化为 NH4+，然后结合氨离子生成稳定的铵盐，降低水中有毒氨的毒性。
05有助于培藻，增强池塘自净能力
在高pH塘口使用有机酸除了降低pH以外，同时可以为藻类提供碳源，使有益藻类更容易生长，控制有害藻类。
06降低水体pH和稳定水质
在放苗前及养殖过程中使用，能迅速降低高的pH值，并稳定池水的pH值，稳定水质。